작년 2월까지 병원에서 일하다가 3월부터 지금의 약국에서 일하고 있어요.

병원에서 1-2월 원천징수내역서를 떼었더니

세액명세 항목에 결정세액이 공란이고, 

기납부내역에 소득세 650,440원 지방소득세 65,030원

따라서 차감징수세액이 소득세 -650,440원 지방소득세 -65,030원이었어요.

약국장님께서 갑근세 내주시는 조건이고 환급금이 발생하더라도 저는 받을 수 없는 조건인데요,

약국장님께 650,440+65,030원을 드려야 하는 건가요?

원칙적으로 세법상 근로소득세는 근로자부담이지만, 실무에서 실수령액 기준으로 계약을 해서 발생되는 문제들입니다.

650,440+65,030은 병원쪽에서 일한 급여에 대한 매월 차가감 금액이고,

이것을 약국근로소득과 합산하고 연말정산하면, 또 금액이 달라질수 있습니다. 소득세는 세율이 누진구조이고, 소득공제 세액공제따라 달라지기 때문에요..

에초에 실수령액의 계약이란게 근로기준법상과 다른게 계약된 상태이기 때문에, 말씀하신금액 또는 정산이후에 나온금액을 병원, 약국소득으로 안분한금액으로 적당선에서 타협하시면 될듯 합니다.